حسن شاهوارپور در مقام فرمانده سپاه استانی خوزستان (سپاه ولیعصر) نقش اصلی را در سرکوب خشن معترضان اعتراضات آبان ماه ۱۳۹۸ و نقض حق آزادی، اعتراض و به ویژه حق حیات آنها در این استان داشته است. نیروهای تحت امر او در جریان این اعتراضات تعداد بسیاری از معترضان را با استفاده از سلاح‌های گرم سنگین و شلیک مستقیم گلوله در ماهشهر به قتل رساندند.ایالات متحده آمریکا در دی ماه ۹۸ حسن شاهوارپور را به دلیل همین عملکرد در فرماندهی قتل عام معترضان در خوزستان در لیست تحریم‌های حقوق بشری خود قرار داد. به گفته وزارت خارجه آمریکا، نیروهای شاهوارپور در سپاه ولیعصر خوزستان، دست کم ۱۴۸ معترض را در ماهشهر به قتل رساندند. او بعدها در سالهای 1400 و 1401 به همین دلیل توسط اتحادیه اروپا و دولت بریتانیا نیز تحریم شد.
حق آزادی، حق اعتراض و حق حیات:حسن شاهوارپور به عنوان فرمانده سپاه ولیعصر در استان خوزستان مسئولیت اصلی سرکوب معترضان در جریان اعتراضات آبان ماه ۱۳۹۸ را بر عهده داشته و از این رو در برابر سرکوب شدید و خشونت بار آنها که سبب جان باختن تعداد زیادی از معترضان شد مسئول است. او خود ۲۹ آبان ماه خطاب به معترضان گفته بود: «امنیت خط قرمز ماست و نظام هیچ ملاحظه‌ای نسبت به تعرض کنندگان به این امنیت نخواهد داشت.»بر اساس گزارش‌های منتشر شده شهرهای استان خوزستان از جمله شهرهایی بوده که شدت اعتراضات معترضان آبان ماه ۹۸ در آن بالا و در نتیجه سرکوب و خشونت اعمال شده از سوی ماموران امنیتی و انتظامی نیز بسیار بیشتر بوده است (ویدئو شلیک ماموران به معترضان در بهبهان). غلامرضا شریعتی استاندار خوزستان خود بالا بودن شدت اعتراضات در ۱۵ شهر این استان را تایید کرده بود. محسن بیرانوند فرماندار شهرستان ماهشهر در خوزستان نیز ۱۱ آذر ماه در گفتگو با صدا و سیمای جمهوری اسلامی تایید کرده بود که برای سرکوب معترضان در این شهرستان نیروهای امنیتی و انتظامی با معترضان درگیر شدند.در ماهشهر نیروهای سپاه ولیعصر خوزستان با فرماندهی حسن شاهوارپور برای سرکوب معترضان اقدام به استفاده از سلاح‌های سنگین، خودروهای زرهی و تانک کردند (ویدئو حضور خودورهای زرهی در ماهشهر). بر اساس روایت‌های منتشر شده در برخی مناطق ماهشهر از جمله منطقه کوره‌ها یا همان شهرک طالقانی درگیری‌ها به مانند منطقه جنگی بوده است.روزنامه نیویورک تایمز در آذر ماه ۱۳۹۸ و پس از برقراری دوباره اینترنت در استان خوزستان در گزارشی جزییاتی از قتل عام صورت گرفته توسط نیروهای سپاه در ماهشهر را منتشر کرد. بر اساس این گزارش به نقل از شاهدان عینی، دستکم بین ۴۰ تا ۱۰۰ نفر در جریان اعتراضات ۲۷ آبان ماه تنها در نیزارهای ماهشهر با شلیک مستقیم گلوله ماموران سپاه پاسداران کشته شدند.به گفته نیویورک تایمز پس از ورود نیروهای سپاه به ماهشهر و اقدام به تیراندازی به سمت معترضان، تعدادی از آنها به نیزارهای اطراف فرار کرده و در آنجا پناه می‌گیرند اما نیروهای سپاه با مسلسل سنگین «دوشکا» به معترضان پناه گرفته در نیزارها شلیک می‌کنند (ویدئو فرار معترضان و شلیک ماموران) . آنطور که در گزارش روزنامه نیویورک تایمز آمده، ماموران سپاه پس از کشتار معترضان، اجساد آنها را بار کامیون‌های نظامی کرده و با خود می‌برند.تصاویر منتشر شده در شبکه‌های اجتماعی از ماهشهر نیز استفاده از خودروهای سنگین زرهی مانند تانک و نفربر و همچنین استفاده از مسلسل دوشکا توسط نیروهای سپاه برای سرکوب معترضان را تایید می‌کند. (ویدئو شلیک مستقیم ماموران به معترضان در ماهشهر)صدا و سیمای جمهوری اسلامی خود در ۱۲ آذر ماه با پخش گزارشی کشته شدن تعدادی از معترضان در نیزارهای ماهشهر را تایید می‌کند. اگرچه در این گزارش کشته شدگان افرادی «اغتشاشگر» و «اشرار» خوانده می‌شوند اما شلیک گلوله به سمت آنها از سوی نیروهای امنیتی و انتظامی مورد تایید قرار می‌گیرد.در گزارش تحقیقی شبکه تلویزیونی فرانسه ۲۴ که با استفاده از تصاویر منتشر شده در شبکه‌های اجتماعی از کشتار ماهشهر تهیه شده، تیراندازی نیروهای سپاه با استفاده از مسلسل دوشکا به سمت نیزارها به وضوح دیده می‌شود.تعداد دقیق معترضان کشته شده در ماهشهر در جریان اعتراضات آبان ماه ۱۳۹۸ مشخص نیست و آمارهای متفاوتی از آن ارائه شده است. نیویورک تایمز به نقل از یک روزنامه نگار محلی تعداد کل معترضان جان باخته در ماهشهر را ۱۳۰ نفر اعلام کرده است. سازمان عفو بین الملل در گزارش تفصیلی خود از جان باختگان اعتراضات آبان ماه که اردیبهشت ۱۳۹۹ منتشر شد، ۳۰ تن از قربانیان اعتراضات در ماهشهر را شناسایی و مرگ آنها را تایید کرده است.
عملکرد: هفته آخر شهریور ماه 1401 آغازی بر دور جدید اعتراضات گسترده مردمی شد. این اعتراضات با جان باختن مهسا (ژینا) امینی در پی عملکرد گشت ارشاد آغاز شد و اما ابعادی گسترده به خود گرفت. این اعتراضات گسترده در بسیاری از نقاط کشور با برخوردهای شدید نیروهای سپاه پاسداران، بسیج، انتظامی و دیگر نیروهای امنیتی سرکوب شد و ده‌ها شهروند کشته و زخمی و شهروندان بسیاری بازداشت شدند. استان خوزستان نیز یکی از این مناطق در کشور است که مردم معترض در آن به خیابان ها آمدند و توسط نیروهای سپاه پاسداران، بسیج، انتظامی و دیگر نیروهای امنیتی سرکوب شدند. در جریان این سرکوب‌ها شماری از شهروندان معترض در استان خوزستان نیز کشته شدند. اسامی برخی از آنها عبارتند از: عماد حیدری، عباس لویمی، مهدی فراهانی، رشید رشیدی، میلاد سعیدیان جو، حامد سلحشور، محمد قائمی فر و محمد خواجوی دره بالایی. (هرانا – زن، زندگی، آزادی؛ گزارش تفصیلی از ۸۲ روز اعتراض در سراسر ایران)10 تیر 1402: معاون فرهنگی، هنری سپاه حضرت ولی عصر خوزستان از برگزاری عملیات فرهنگی با موضوع حجاب و عفاف در استان خبر داد. به گفته او این عملیات فرهنگی جهت مقابله با ناهنجاری‌های اجتماعی و با “موضوع تولیدات هنری از قبیل ساخت موشن گرافیک، نماهنگ، پوستر، عکس نوشته و فیلم کوتاه” برگزار شده بود. (خبرگزاری دفاع مقدس- اجرای عملیات فرهنگی در خوزستان با موضوع عفاف و حجاب)
